Meteor 1.1 přišel s podporou MongoDB až do verze 3 a předpokládá se, že Meteor budete moci používat v produkci spolu s databází MongoDB 3.0 bez větších problémů.
Rozhodli se však ponechat větev 2.6 týkající se verze Mongo dodávanou s nástrojem Meteor a počkat, až bude Mongo 3.0 dostatečně vyspělé, než ji začlení do oficiálních verzí Meteoru.
Znamená to, že Meteor aktualizuje verzi svého interního nástroje MongoDB automaticky, ale svým vlastním tempem.
Místní prostředí Mongo dodávané s vývojovým nástrojem Meteor je něco jiného než skutečné nasazení Mongo, které obvykle používáte v produkci, a není vyžadováno, aby byly obě verze stejné.