Takto to nejde. rozlišující
je databázový příkaz a --query možnost umožňuje použít pouze dotaz
pro filtrování dokumentů.
Pokud používáte mongodb v3.4 nebo novější, můžete použít zobrazení agregovat vaši sbírku a exportovat ji ze zobrazení.
Nejprve vytvořte pohled v mongo shell:
db.createView("distinctCollectionUid", "collection", [{ $group: { _id: "$uid"}}]);
Poté jej exportujte:
mongoexport -d db -c distinctCollectionUid --type=csv -f "_id" -o distinctUid.csv