Chápu, co máte na mysli o metodách, ale myslím, že problém s pokusem db.command je v tom, že se pokoušíte spustit pomocníka shellu jako příkaz spíše než samotný příkaz. Skutečný příkaz je v tomto formátu:
// get current levels
db.runCommand({ profile : -1 })
// set the level to log slow ops
db.runCommand({ profile : 1 })
// set to log slow ops and change the threshold to 200ms
db.runCommand({ profile : 1, slowms : 200 })
//revert to defaults
db.runCommand({ profile : 0, slowms : 100 })
Pokud se tedy pokusíte předat příslušnou hodnotu do db.command, mělo by to fungovat.