Jsem v úplně stejné situaci, postupoval jsem přesně podle stejných kroků a měl jsem stejný problém.
Co pro mě fungovalo, bylo:
sudo service mongod stop
sudo apt-get purge mongodb-org*
NEODSTRAŇUJTE datové adresáře - Pokud tak učiníte, všechna vaše data budou ztracena.
Poznámka:Volání sudo apt-get purge mongodb-org* odstraní mongod.conf soubor. V případě, že si chcete tento soubor po aktualizaci ponechat, nezapomeňte vytvořit záložní kopii a používat jej po instalaci nové verze.
Poté nainstalujte mongodb s:
sudo apt-get install -y mongodb-org
To předpokládá, že jste již provedli předchozí instalační kroky (import veřejného klíče, vytvoření souboru seznamu, opětovné načtení lokální databáze balíčků), jak jste uvedli.