Neviděl jsem odpověď a dnes jsem měl stejnou otázku.
Databázi můžete předtím zrušit pomocí:
use <db>
db.dropDatabase()
Nebo můžete sbírku zahodit pouze pomocí:
db.<collection>.drop()
Problém s vaším příkazem může být v tom, že něco chybí, například databáze, proti které se ověřujete, uživatel nebo možná jiná věc.
V mém nastavení to funguje
mongorestore --username=<user> --db=<database> --authenticationDatabase=<database> --dir=<dumpdir> --drop
Pokud byl váš výpis zazipován předem, můžete na závěr přidat příznak --gzip.
To vše najdete v dokumentaci pro odstranění databáze nebo v dokumentaci zrušení celé databáze. Ale buďte s tím prosím opatrní.