Nemusíte kopírovat žádné soubory ručně, jak naznačují jiné odpovědi. Na Windows i Mac můžete exportovat všechna svá nastavení v rámci MySQL Workbench a obnovit je do jiného systému.
Select Tools > Configuration > Backup Connections
Tím se exportuje jako .zip. Pak na vaší nové nové instalaci stačí
Select Tools > Configuration > Restore Connections
To je ono!