Jde jen o to nainstalovat verzi 3.5.8.2. Viz http://docs.phpmyadmin.net/en/latest /setup.html#quick-install .
Pokud jste nenainstalovali konfigurační tabulky úložiště phpMyAdmin, které jsou specifické pro verzi 4, nemáte nic jiného na práci. Samozřejmě záleží na adrese URL, kterou používáte k návštěvě phpMyAdmin, a na tom, zda jste si verzi 4.0 nainstalovali sami nebo jste použili předbalenou instalaci.
Nechápu, proč byste tím přišli o své databáze.