Domnívám se, že jediná věc, kterou byste při změně domény museli změnit, je přístup k uživatelskému účtu na serveru. Když jste nainstalovali SQL Server, proces instalace udělil určitá práva účtu, který používáte ke spuštění služby SQL. Pokud se jednalo o účet domény (např. OLDDOMAIN\SQL_Proxy), budete muset stejná práva udělit účtu proxy ve vaší nové doméně (např. NEWDOMAIN\SQL_Proxy).
Pokud na druhou stranu používáte ke spuštění služby SQL „LOCAL SYSTEM“, neměli byste provádět žádné změny, protože tento účet bude mít i nadále dostatek práv ke spuštění služby SQL.
Po spuštění tohoto procesu odešlete zprávu – zajímalo by mě, zda jste během převodu nenarazili na nějaké překážky.