Pokud jsou dvě databáze na stejném serveru, měli byste být schopni vytvořit příkaz SQL přibližně takto:
UPDATE Test1.dbo.Employee
SET DeptID = emp2.DeptID
FROM Test2.dbo.Employee as 'emp2'
WHERE
Test1.dbo.Employee.EmployeeID = emp2.EmployeeID
Z vašeho příspěvku mi není zcela jasné, zda chcete aktualizovat Test1.dbo.Employee s hodnotami z Test2.dbo.Employee (to je to, co dělá můj dotaz), nebo naopak (protože zmiňujete db na Test1 byl nový stůl......)