Zkontrolujte dokumenty http://php.net/manual/en/ref.pdo -mysql.php .
V zásadě potřebujete:
PDO::MYSQL_ATTR_LOCAL_INFILE => true
Nastaveno při vytváření instance.
Příklad:
$conn = new \PDO("mysql:host=$server;dbname=$database;", "$user", "$password", array(
PDO::MYSQL_ATTR_LOCAL_INFILE => true,
));