Právě jsem narazil také na tento problém. Musel jsem přidat LOCAL na můj příkaz SQL.
Například to způsobí problém s oprávněním:
LOAD DATA INFILE '{$file}' INTO TABLE {$table}
Přidejte LOCAL k vašemu prohlášení a problém s oprávněními by měl zmizet. Asi takhle:
LOAD DATA LOCAL INFILE '{$file}' INTO TABLE {$table}