Zde je odpověď, jak navrhl Alexandre:
když použijete id=LAST_INSERT_ID(id), nastaví hodnotu mysql_insert_id =aktualizované ID – takže váš konečný kód by měl vypadat takto:
<?
$query = mysql_query("
INSERT INTO table (column1, column2, column3)
VALUES (value1, value2, value3)
ON DUPLICATE KEY UPDATE
column1 = value1,
column2 = value2,
column3 = value3,
id=LAST_INSERT_ID(id)
");
$my_id = mysql_insert_id();
To vrátí správnou hodnotu pro $my_id bez ohledu na aktualizaci nebo vložení.