K tomu nepotřebujete substr ani mysql. Nejprve získejte data bez substr:
$tawal = date('Y-m-d', strtotime($date));
$takhir = date('Y-m-d', strtotime($date1));
Nyní máte ve formátu Y-m-d řetězce. Chcete-li najít rozdíl, ale nemusíte převádět na Y-m-d, protože nepotřebujeme mysql. Můžete použít tuto metodu najít rozdíl v sekundách.
$diff = abs(strtotime($date2) - strtotime($date));
$years = floor($diff / (365*60*60*24));
$months = floor(($diff - $years * 365*60*60*24) / (30*60*60*24));
$days = floor(($diff - $years * 365*60*60*24 - $months*30*60*60*24)/ (60*60*24));