Našel jsem řešení tohoto problému v aptana fórum .
Tam se píše, že klientská knihovna MySQL 5.1 si nehraje dobře s Rails 2.2 Řešení, které nabízejí, je jednoduché:stáhněte si starší klientskou knihovnu MySQL (libmySQL.dll ) a zkopírujte jej do složky Ruby\bin.
Toto fungovalo pro mě (Windows XP, Ruby 1.8.6, Rails 2.3.3, mysql 5.1.33)