Přejděte na Upravit -> Předvolby -> SQL Editor a tam uvidíte:
DBMS connection keep-alive interval (in seconds): 600
DBMS connection read time out (in seconds): 600
DBMS connection time out (in seconds): 60
Interval udržování spojení DBMS znamená, jak často Workbench odesílá požadavek na zachování spojení na server, aby spojení zůstalo živé.
Od 5 minut ==300 sekund, nastavit interval udržování připojení DBMS <300 (např. 250)
Bude to znamenat "odesílat požadavek na zachování života každých 250 sekund". Klikněte na OK.
Poté ukončete MySQL Workbench a znovu jej spusťte, aby se změny projevily.
Pokud používáte standardní metodu připojení TCP/IP přes SSH, může být také užitečné nakonfigurovat ssh ServerAliveInterval.