Každý sloupec s klíčem (primárním, cizím) potřebuje index. Totéž se sloupcem, který je jedinečný. Pravděpodobně jste vytvořili dva indexy (jeden při vytváření FK a jeden na jedinečné podmínce). Pokud je to váš případ, stačí jeden z těchto indexů vypustit.
Pro DB je režie udržovat dva ekvivalentní indexy.