Uživatel @smcjones zmiňuje použití souboru .my.cnf nebo mysql_config_editor. To jsou dobré návrhy, dávám mu hlas +1.
Dalším řešením je vložit přihlašovací údaje do libovolného souboru podle vašeho výběru a poté tento soubor zadat při vyvolání nástrojů MySQL:
mysql --defaults-extra-file=my_special.cnf ...other arguments...
A nakonec jen pro úplnost, pro některé možnosti, jako je hostitel a heslo, můžete použít proměnné prostředí. Ale kupodivu ne uživatel. Viz http://dev.mysql.com/doc/ refman/5.7/en/environment-variables.html
export MYSQL_HOST="mydbserver"
export MYSQL_PWD="Xyzzy"
mysql ...other arguments...
Opravdu nedoporučuji používat pro heslo proměnnou prostředí, protože každý, kdo umí spustit ps na vašem klientském hostiteli můžete vidět proměnné prostředí pro proces klienta mysql.