Zveřejňuji svou odpověď z https://stackoverflow.com/a/46609559/492336 :
Tento příkaz SQL můžete spustit z MySqlConnection:SHOW SESSION STATUS LIKE 'Ssl_cipher'
a zobrazí se vám, zda je připojení šifrováno.
Příklad kódu:
var connection = new MySqlConnection(ConfigurationManager.AppSettings["Test"]);
connection.Open();
var command = new MySqlCommand("SHOW SESSION STATUS LIKE \'Ssl_cipher\'", connection);
MySqlDataReader reader = command.ExecuteReader();
while (reader.Read())
{
Console.WriteLine($"{reader.GetString(0)}: {reader.GetString(1)}");
}