Pokud to pomůže, měl jsem stejný problém a mohl bych to opravit odstraněním všech souborů mysql záhadně vygenerovaných v datovém adresáři:
Stačí odstranit všechny hlavní soubory a ponechat svou datovou složku jako tento obrázek:
Snad to pomůže. Na zdraví!
EDIT – Po smazání všech těchto souborů musím pokaždé, když se pokusím znovu spustit Mysql, smazat aria_log.00000001 (toto číslo se zvyšuje pokaždé, když spustím Mysql). Mějte to na paměti, pokud se to bude opakovat znovu.