Budete jej muset zkompilovat ručně, místo přes PECL. Musíte vědět, kde je vaše instalace MySQL. Nevím o balíčcích Entropy, ale sestavení poskytovaná MySQL (kterou doporučuji) se instalují do /usr/local/mysql .
$ pecl download pdo_mysql
$ tar xzf PDO_MYSQL-1.0.2.tgz
$ cd PDO_MYSQL-1.0.2
$ phpize
$ ./configure --with-pdo-mysql=/usr/local/mysql
$ make && sudo make install
A to by vás mělo dostat do bodu, kdy to můžete nakonfigurovat.