Neuzavíráte správně smyčku while. Uzavřete smyčku while následovně.
<?php
$sql = "SELECT room FROM campus";
$result = mysqli_query($sql);
while ($line = mysqli_fetch_array($result, MYSQL_ASSOC)) {
?>
<input type="checkbox" name="car" value="<?php echo $line['room']?>" />
<?php
}
?>