Po vyzkoušení několika oprav jsem spustil MySQL server pomocí$ sudo mysql.server start
pak pokračovali s $ mysql_secure_installation
pro nastavení hesla pro uživatele root.
Toto fungovalo pro mě.
Poznámka:Homebrew vás požádá, abyste nejprve provedli mysql_secure_installation
před prvním spuštěním MySQL serveru, ale to vedlo k výše uvedené chybě.