AFAIK, nemůžete zapojit název souboru do adresy URL JDBC pro MySQL. MySQL musí běžet a musíte se k němu připojit přes jeho TCP port. Něco jako:
jdbc:mysql://localhost:3306/yourDatabaseName
Viz http://dev. mysql.com/doc/refman/5.6/en/connector-j-reference-configuration-properties.html