Zdá se, že používáte InnoDB tabulky, takže byste měli také zkopírovat soubory ib* v datové složce (to však přepíše jakoukoli tabulku InnoDB vytvořenou v nové instalaci.)
Alternativně (ještě lépe) můžete nastavit parametr 'datadir' v konfiguračním souboru a zadat cestu k datové složce ve staré instalaci.