Jak automaticky generovat sloupce rozlišující malá a velká písmena pomocí JPA v MySQL

@Column anotace ve vašem poli může specifikovat atribut columnDefinition, který vám může umožnit určit řazení pro daný sloupec s rozlišováním malých a velkých písmen.

Ve vašem případě byste například pomocí anotace @Column použili

@Column(name = "NAME_COL", columnDefinition = "VARCHAR(250) COLLATE latin1_general_cs")
private String name;