dívali jste se na konvici pentaho (nebo integraci dat pentaho)? http://kettle.pentaho.org/
používáme ho ke kopírování a synchronizaci různých databázových systémů, jako je mssql<->mysql, což je zřejmě to, co požadujete.
Konvice je ještě výkonnější, umožňuje vám dotazovat se na databáze ldap, přímo textové soubory atd...
jeho nástroj pro vytváření diagramů je podobný vzhledu a chování jako dts od společnosti Microsoft (ale výkonnější, imho)