Doporučil bych PostgreSQL přes MySQL. Myslím, že je to robustnější. Ale podle mého názoru má spíše příchuť Oracle.
AKTUALIZACE:
Všechny dosud poskytnuté návrhy jsou svou povahou vztahové. Existují další alternativy, například databáze objektů . Existuje celá řada "žádné SQL" odstěhovat se a plakat v divočině po nerelačních alternativách. Možná by stály za shlédnutí.