Dnes jsem narazil na úplně stejný problém poté, co jsem provedl změnu, která by Doctrine neměla nijak ovlivnit (změnil jsem Twig šablona). Po nějaké době jsem si uvědomil, že protože jde o podivnou chybu kompilace v podivný okamžik, pravděpodobně restarting php-fpm by udělal trik. A stalo se.
Možná restartování Apache udělá totéž, pokud jste na mod_php .