Používá se COUNT v GROUP_CONCAT

Musíte COUNT() pomocí GROUP BY ve vnitřním SELECT nejprve klauzuli a poté použijte GROUP_CONCAT();

SELECT GROUP_CONCAT(cnt) cnt
FROM (
    SELECT COUNT(*) cnt
    FROM table1
    GROUP BY fk_company
) q;

Výstup:

|   CNT   |
-----------
| 3,2,3,1 |

Zde je SQLFiddle demo.