Podívejte se na použití CNAME. Jedním ze způsobů, jak ověřit vlastnictví domény, je přimět uživatele, aby si vytvořili vlastní CNAME ve svých záznamech DNS, a nechat váš web, aby se k nim pokusil přistupovat.
Další by bylo trochu pracnější, ale přimět uživatele, aby přidali značku metadat na svůj web a aby se vaše stránka znovu pokusila o přístup a přečtení těchto meta informací, abyste prokázali, že mají na stránku přístup – tedy ověření vlastnictví.
AKTUALIZACE:
dns-get-record
Prostudujte si ZDE dokumentaci PHP o získávání a kontrole DNS záznamů (CNAME být jedním z nich)