Transakce jsou atomické pouze s ohledem na jiná databázová připojení, která se snaží použít stejná data, tj. u ostatních připojení se zobrazí buď ne změny provedené vaší transakcí nebo všechny Změny; "atomový", což znamená, že žádné jiné databázové připojení neuvidí stav mezi tím, kdy některá data budou aktualizována a jiná nikoli.
PHP kód mezi dotazy nenaruší atomicitu a nezáleží na tom, kde své příkazy připravíte.