Je to trochu složité najít v příručce, pokud nevíte, co hledat, ale toto by vám mělo pomoci:http://book.cakephp.org/view/1027/query
např. něco ve smyslu:
$gLat = 42.450071;
$gLong = -76.487664;
$this->Node->query("INSERT INTO nodes (Location) VALUES (GeomFromText('POINT({$gLat} {$gLong})'))");