Po vyzkoušení mnoha věcí jsem si všiml, že funkce to_sql negeneruje správnou syntaxi MySQL, aby fungovala. Také s přístupem ke změně na wkb MySQL stále nerozpoznalo tento sloupec jako geometrii, pokud nechám text tak, jak je (viz obrázek v otázce).
Co pro mě fungovalo, bylo změnit pole geometrie na řetězec a aktualizovat ho v pythonu, takže by to vypadalo takto:
Poté jsem přistoupil k použití níže uvedeného kódu, kde jsem odeslal datový rámec do MySQL a poté aktualizoval tabulku, aby nastavil sloupec geometrie:
regions.to_sql('pr_regions', con=conn, schema='eq_pr_db',
if_exists='replace', index=False)
#add column type Polygon
conn.execute('''ALTER TABLE `eq_pr_db`.`pr_regions`
ADD COLUMN `geom` Polygon;''')
#populate new column by applying the ST_GeomFromText function to transform the string to geometry type.
conn.execute('''UPDATE `eq_pr_db`.`pr_regions`
SET geom = ST_GeomFromText(geometry) ;''')