Hledáte pouze název sloupce ze všech názvů sloupců v celé instanci MySQL. Musíte také filtrovat podle schématu (=databáze) a názvů tabulek:
IF EXISTS(SELECT * FROM INFORMATION_SCHEMA.COLUMNS WHERE COLUMN_NAME = N'CustomerVariable1Value' AND TABLE_NAME = 'MyTableName' AND TABLE_SCHEMA = 'MyDatabase')