Proč tento jednoduchý dotaz MySQL nevrací řádek?

Problém je pravděpodobně ve vaší metodě kontroly NULL. V MySQL vyzkoušejte následující:

SELECT `id` FROM `users` WHERE `username` = "test" AND `id` IS NOT NULL;

Pro kontrolu NULL a prázdného řetězce můžete použít:

SELECT `id` 
FROM `users` 
WHERE `username` = "test" 
AND (`id` IS NOT NULL OR `id` != "");