Můžete použít mysqldump -A generovat výpisy SQL pro všechny databáze.
Odkaz:http://dev.mysql.com/doc/refman /5.1/cs/mysqldump.html
Případně můžete také pouze zkopírovat adresář aktuálních dat.
Edit:Omlouvám se, že nejsem konkrétní, jak poznamenali ostatní, bude fungovat pouze ISAM. Pro innodb budete muset zálohovat pomocí mysqldump nebo jiného nástroje, jako je phpMyAdmin.