Zde je analyzátor Jak analyzovat soubor CSV pomocí PHP místo echo byste měli tlačit na data pole, která po načtení vloží hromadně do databáze. Navíc máte možnost iterovat všech svých 1000 souborů. http ://www.php-dev-zone.com/2013/05/how-to-import-csv-file-data-into-mysql.html něco takového