V mém případě jsem zjistil, že hlavní příčinou je MySQL-Python databázový ovladač a opravou je použití jiných ovladačů MySQL pro Python (např. mysqlclient ).
$ pip uninstall MySQL-Python
$ pip install mysqlclient
MySQL-python se ukázalo být velmi staré (poslední commit byl před 7 lety). mysqlclient je jeho moderní verze se spoustou vylepšení a oprav chyb.
Další podrobnosti o mé opravě a zjištěních zde .