Když zavoláte PDO::beginTransaction() , vypne automatické potvrzení.
Takže můžete:
$db->beginTransaction();
$db->exec('LOCK TABLES t1, t2, ...');
# do something with tables
$db->commit();
$db->exec('UNLOCK TABLES');
Po commit() nebo rollBack() bude databáze zpět v režimu automatického odevzdání.