Dlouhé dotazy jsou známkou špatného designu. Nejlepší je zkontrolovat příslušné dotazy a jak je lze optimalizovat. To by bylo jen ignorování problému.
Pokud to přesto chcete, můžete použít příkaz SHOW PROCESSESLIST k získání všech běžících procesů. A pak použijte KILL x k ukončení klientského připojení. Ale aby to fungovalo, musíte to zkontrolovat z jiného skriptu PHP, protože multithreading zatím není možný. Také není vhodné dávat uživatelům využívaným PHP granty, aby si zahrávali s nastavením serveru.