Není zcela jasné, co přesně způsobuje problém, protože jste vynechali nejdůležitější část – kód, který tuto výjimku vyvolá, ale pokud přidáte vlastnosti vztahu do třídy PostModel hody, které se snaží přidat cizí_klíče parametr k vztahu zavolejte následovně:
class PostModel(...):
# ...
subject1_id = Column(db.Column(db.BigInteger, db.ForeignKey(EntitiesModel.id), nullable=False)
subject2_id = Column(db.Column(db.BigInteger, db.ForeignKey(EntitiesModel.id), nullable=False)
subject1 = relationship(EntitiesModel, foreign_keys=subject1_id)
subject2 = relationship(EntitiesModel, foreign_keys=subject2_id)