Všiml jsem si, že se mi to začalo dít dnes, nějakou dobu poté, co jsem již pro svůj projekt aktualizoval na .NET Core 3 a neměl jsem žádné problémy. Ukázalo se, že výchozí lešení používané při přidávání prázdného ovladače mvc pomocí průzkumníka řešení přidá odkazy na EF Core 3 do vašeho webového projektu. EF Core nepoužívám v našich produkčních webových projektech. Pro mě to byl konflikt s testovacím projektem, který používáme a který používá jinou verzi EF Core pro nějaké zesměšňování databáze.
Každopádně prozatím nebudu přidávat ovladače přes možnosti studia, aby se tak nestalo.