můžete použít agregaci mongodb k získání přesného výstupu, jak to vyžaduje
Account..aggregate([
{$match:{'buildings.gateways.devices.verificationCode':"4146"}},
{$unwind:"$buildings"},
{$unwind:"$buildings.gateways"},
{$unwind:"$buildings.gateways.devices"},
{$match:{'buildings.gateways.devices.verificationCode':"4146"}}
])