Takže po zadání výše uvedené otázky jsem si rychle uvědomil, co jsem udělal špatně.
UJISTĚTE SE, ŽE VAŠE DATOVÁ SLOŽKA NENÍ SLEDOVÁNA SPOLEČNOSTÍ GRUNT
Měl jsem svou datovou složku ve složce serveru vytvořené projektem yeoman, který byl sledován gruntem, ale také zamčený mongodem. Přesunul jsem svou datovou složku (jsem si jistý, že byste místo toho mohli ignorovat datový adresář) a nyní to funguje dobře.
Doufám, že to někomu jinému ušetří 20 minut, které mi trvalo, než jsem na to přišel :)
L