Závisí na datovém typu proměnné vašeho města. Pokud je proměnná města typu BsonValue, můžete použít ?? přímo operátor:
BsonValue city = null;
var query = Query.EQ("city", city ?? BsonNull.Value);
Console.WriteLine(query.ToJson());
Pokud je vaše proměnná města typu string, potřebujete extra přetypování konverze, aby byl kompilátor spokojený:
string city = null;
var query = Query.EQ("city", (BsonValue)city ?? BsonNull.Value);
Console.WriteLine(query.ToJson());