Klienta mysql můžete také obecně použít na samotném serveru. U importovaných velkých DB to bývá můj oblíbený.
mysql -u user -p -h localhost dbname < import.sql
Nebo ve vašem případě přejděte na příkazový řádek (stejné jako okno SQL v phpmyadmin:
mysql -u user -p -h localhost dbname