Cizí klíče v MyISAM jsou pouze pro informační účely. Můžete se na ně podívat, abyste viděli, kde by by byla referenční integrita být, kdyby nějaké byly. Je snazší porozumět schématu tímto způsobem, než hádat vztahy pohledem na indexy vytvořené jako vedlejší efekt.
Nevím, proč by to zmizelo v phpMyAdmin, pokud to není problém s konfigurací (věřím, že zobrazení lze zakázat)?