Nemám ponětí, proč to funguje, ale šel jsem do svého NuGet Package Manager a odstranil MySql.Data.Entity (také zkontroloval závislosti, které odstranily MySql.Data). Šel jsem do svého .edmx a spustil 'Aktualizovat model z databáze...' a vše fungovalo.
(Poznámka:To také odstranilo můj rámec entity, takže jsem ho musel přidat zpět pomocí Správce NuGet)
W...T...F?
Možná to ostatní potvrdí...