mělo by to tak být,
$this->db->select('*');
$this->db->from('table1');
$this->db->join('table2', 'table1.id = table2.id');
$this->db->join('table3', 'table1.id = table3.id');
$query = $this->db->get();
podle rámce aktivních záznamů CodeIgniters