(setq sql-mysql-program "/path/to/your/mysql")
(setq sql-user "mysql user")
(setq sql-password "password")
(setq sql-server "mysql-server")
(setq sql-mysql-options "optional command line options")
dodávání některých hodnot těmto proměnným prostřednictvím vašeho .emacs by měl pomoci vaší situaci.